Es Hecho que el Quechua Cusqueño tiene lo más Alófonos, entonces, lo más realizaciones vocálicas !
Pero no son 5 ! Son más ! Al lo menos son 6 ! Porque la A de kAchi y qAqA son bien diferente. La A de Chay se parece más a una E que a una A en el oído castellano.

Michiq es en Ayacuchano: /michEq/ y en cusqueño /michIq/ la I siendo el sonido de la i de ‘king’ , rey en inglés.

Algunos cusqueños suelen escribir una I y una U cuando ellos escuchan el sonido de i de ‘king’ y la u de ‘put’ en inglés. Pero esta forma de escritura discrimina al sonido de A de ‘father’ del inglés, que existe en Qaqa, pero este sonido no es lo mismo como la A de kachi o ñan, que se parece más a una O de ‘Got’ del inglés americano.
Por eso escribir con 5 letras para representar los sonidos vocales es un error lingüistico.

Pero lo que está pasando con el Quechua Cusqueño pasa con todas las variantes de las cuidades capitales. También el castellano de Lima es bien diferente que el estándar !! Ejemplo = jóvenes Limeños no dicen ‘amigo’ sino Amío.
Y el Neerlandés de Amsterdam ha perdido sus sonidos sonoros y el alemán de Berlín perdió sus casos gramaticales. Es que los cambios empiezan desde el centro lingüistico. Así el Quechua Central tiene una fonología bien cambiada. Es el Quechua Cajamarquino, un Quechua-IIA que es conservador en sus sonidos, por no estar en el centro lingüistico.